La Direction des Services Numériques (DSN) de l’AP-HP fournit des services numériques aux patients et aux professionnels, dont le dossier patient, des systèmes pour la biologie et l’imagerie. Elle fournit également des services pour la réutilisation secondaire des données de santé, au service du pilotage, de la recherche et de l’innovation, au travers du EDS.

A l’AP-HP, le site hospitalier de la Pitié Salpêtrière assure une activité de biologie médicale 24h/24 et 7 jours sur 7. L’activité́ de biologie est organisée dans 10 services ou structures internes au département médico-universitaire BioGem, parmis lesquels l’unité fonctionnelle de génomique du développement du département de génétique médicale.

Dans le cadre de ses activités de médecine génomique, le département de génétique médicale héberge des compétences en bioinformatique, et travaille également en étroite collaboration avec MOABI, la plateforme de bioinformatique de l’APHP. 

Au sein du pôle Innovation et Données de la DSN de l'AP-HP, la plateforme de bioinformatique MOABI a pour missions la centralisation progressive du stockage des données de génomique produites au niveau de 39 hôpitaux, leur analyse dans le cadre de processus maitrisés et normalisés, la mise à disposition d’outils d’exploitation des résultats, l’animation d'une communauté bioinformatique de l’AP-HP regroupant plusieurs dizaines d'ingénieurs, le support technique et scientifique, la formation et la veille technologique en bioinformatique.

Afin de soutenir plus particulièrement les innovations portées par le département de génétique médicale, tout en renforçant ses activités bioinformatiques transversales de la plateforme MOABI, nous recherchons un.e ingénieur.e en bioinformatique, afin de prendre en charge le développement et la mise en place de pipeline d’analyse de données, et en particulier : 

- Pipeline d’analyse de données d’exome

- Pipeline d’analyse de données de transcriptome 

- Participer au développement de pipeline d’analyse de données Nanopore 

Possibilité de télétravail si le poste le permet ;

Remboursement partiel des transports en commun (75%) ou forfait mobilité ; 

Accès au restaurant du personnel à tarifs avantageux ; 

Un centre formation et de développement des compétences interne pour les formations management, les renforcement Métiers… ;

19 jours de RTT, en plus des 25 jours de congés ; 

Une offre de sorties culturelles, de voyages, de centres de vacances pour les titulaires et CDD sur poste permanent (AGOSPAP), des réductions et des bons plans (HOPTISOINS) ; 

Pour les enfants, crèches internes, voyages culturels, séjours linguistiques et possibilité de bénéficier du supplément familial de traitement.