Service de Mycobactériologie Spécialisée et de Référence

(CNR des Mycobactéries, laboratoire associé)
PRESENTATION

Le service de Mycobactériologie spécialisée et de référence assure les examens de biologie médicale en Mycobactériologie (Tuberculose, Lèpre, Infections à Mycobactéries non tuberculeuses). Par son activité, elle participe à la prise en charge des patients hospitalisés et externes. Elle contribue à l’établissement du diagnostic et assure également une participation au suivi thérapeutique. Ce service comprend des locaux de sécurité biologique NSB2 et NSB3.

COMPOSITION DE L’EQUIPE

Personnel médical : 1 Cheffe de service PU-PH, 2 ETP biologistes (1 PH, 1 PA)

Personnel non médical : 1 cadre de Santé (0,3 ETP), 5 Techniciens de Laboratoire, 2 agents logistique, 1 secrétaire médicale.

Missions principales du technicien de mycobactériologie
Le technicien conduit le diagnostic microbiologique des infections à mycobactéries. Il prend en charge l’ensemble des échantillons qui sont adressés à la structure. Une grande partie du travail est réalisée au sein du laboratoire NSB3 : préparation des échantillons, mise en culture, suivi des cultures, identification et tests phénotypiques de sensibilité aux antimycobactériens. D’autres manipulations sont faites au NSB2 : biologie moléculaire, sérologie, saisie des dossiers, rendu des résultats, stockage de réactifs, accréditation, réunion d’équipe, etc.
Les techniciens n’ont pas d’activité en dehors des locaux du service et ne participent pas à la permanence des soins des autres unités.

Tâches techniques
Ø Décontamination, mise en culture et préparation des examens microscopiques, examens microscopiques en fluorescence et microscopie optique, enregistrement des résultats, suivi particulier des examens positifs
Ø Suivi des cultures, Identification des mycobactéries et tests phénotypiques de sensibilité aux antimycobactériens.
Ø Réaliser des examens complémentaires de biologie moléculaire (PCR hybridation et PCR temps réel, séquençage : SANGER et NGS Illumina)
Ø Dosage par technique Elisa et Chimioluminescence
Ø Mise au point de nouvelles méthodes, participations aux protocoles de recherche clinique, gestion de la conservation des souches, maintenance et entretien des appareils selon les procédures préconisées par les fabricants,
Ø Prise en charge des souches et/ou prélèvements  en tant que Laboratoire associé du Centre National de Référence des Mycobactéries et de la résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux.
Ø Formation des nouveaux techniciens ainsi que les stagiaires avec l’encadrement

Particularités liées à l’enceinte NSB3
Le travail en enceinte de confinement implique le respect de règles de fonctionnement particulières :

 Surveillance et contrôle des flux et qualité de ventilation (signalement des dysfonctionnements)
 utilisation des Équipements de Protection Individuelle (casaque ou pyjama, charlotte, gants, lunettes, masques FFP2,  sur-chaussures, et protections auditives)
 Respect des règles de sécurité et de sureté
 Prise en charge de l’entretien des locaux et des postes de sécurité microbiologique
 Elimination des déchets selon la procédure en vigueur dans la structure (autoclave double entrée)

Suivi de la qualité
 Utilisation du logiciel de gestion documentaire ‘’KALILAB’’ (notamment non conformités analytiques)
 Contrôles de qualité (CQI et EEQ)
 Rédaction et vérification des procédures techniques
 Suivi et traçabilité des évènements indésirables
 Participation aux réunions du service
 Participation des groupes de travail (internes ou institutionnels)
 Etre référent : matériel et, informatique ou qualité
 Répondre aux Audits internes et COFRAC